Ramón Núñez Sánchez inició su carrera académica como investigador en la Universidad Carlos III de Madrid y obtuvo el doctorado en Economía por la Universidad de Cantabria en 2006. Sus líneas de investigación se centran en el desarrollo y la contrastación empírica de modelos microeconómicos aplicados a la regulación y la competencia, la innovación tecnológica y la demanda de energía, con resultados publicados en revistas como Journal of Economic Surveys, Transportation Research Part A y E, y Journal of Transport Economics and Policy.
A lo largo de su trayectoria investigadora ha realizado estancias en el University College London (Reino Unido) y en el University College Cork (Irlanda), así como estancias docentes en Italia y Costa Rica. En el ámbito de la docencia, su actividad reciente se orienta hacia el uso de construcciones dinámicas mediante software de cálculo simbólico, formando parte del Grupo de Innovación Docente para la Enseñanza y el Aprendizaje de la Teoría Económica (IDATEC).
Ha ocupado asimismo diversos cargos de gestión en la Universidad de Cantabria, tanto en la Facultad de Ciencias Económicas y Empresariales como en la Escuela de Doctorado. Desde 2025 ejerce como director de área en el Vicerrectorado de Investigación, Transferencia y Doctorado.