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FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

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fernando.cruz@unican.es

Facultad de Medicina. Avda. Cardenal Herrera Oria, 2. 39011 Santander

Profesor Emérito Ad-honorem

Doctor en Medicina y Cirugía,Doctor en Ciencias Biológicas

Intergenómica

INST. DE BIOMEDICINA Y BIOTECNOLOGÍA DE CANTABRIA

Áreas de especialidad: GENETICA

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117 resultados

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Plasmid classifications

Artículo de Revista

Plasmid, 2023, 126, 102684

Autoría: MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA, SANTIAGO REDONDO SALVO, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

2023

Highlighting the potential of Synechococcus elongatus PCC 7942 as platform to produce alfa-linolenic acid through an updated genome-scale metabolic modeling

Artículo de Revista

Frontiers in Microbiology, 2023, 14, 1126030

Autoría: MARIA DEL CARMEN SANTOS MERINO, ÁLVARO GARGANTILLA-BECERRA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, JUAN NOGALES

2023

IMG/PR: a database of plasmids from genomes and metagenomes with rich annotations and metadata

Artículo de Revista

Nucleic Acids Research, 2023, 1-10

Autoría: ANTONIO PEDRO CAMARGO, LEE CALL, SIMON ROUX, STEPHEN NAYFACH, MARCEL HUNTEMANN, KRISHNAVENI PALANIAPPAN, ANNA RATNER, KEN CHU, SUPRATIM MUKHERJEEP, T. B. K. REDDY, I-MIN A. CHEN, NATALIA N. IVANOVA, EMILEY A. ELOE-FADROSH, TANJA WOYKE, DAVID A. BALTRUS, SALVADOR CASTAÑEDA-BARBA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, BARBARA E. FUNNELL, JAMES P. J. HALL, AINDRILA MUKHOPADHYAY

2023

Isolation and phenotypic and genomic characterization of Tetragenococcus spp. from two Spanish traditional blue-veined cheeses made of raw milk

Artículo de Revista

International Journal of Food Microbiology, 2022, 371, 109670

Autoría: JAVIER RODRÍGUEZ, ANA GONZALEZ GUERRA, LUCÍA VÁZQUEZ, ANA BELÉN FLÓREZ, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, BALTASAR MAYO, RAUL FERNANDEZ LOPEZ

16/06/2022

Evolution of plasmid mobility: origin and fate of conjugative and nonconjugative plasmids

Artículo de Revista

Molecular Biology and Evolution, 2022, 39(6), msac115

Autoría: CHARLES COLUZZI, MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, EDUARDO P.C. ROCHA

2022

Five complete Salmonella enterica serotype reading genomes recovered from patients in the United States

Artículo de Revista

Microbiology Resource Announcements, 2022, 11(7), e0038822

Autoría: HATTIE E. WEBB, KAITLIN A. TAGG, JUSTIN Y. KIM, ELIZABETH A. MILLER, TIMOTHY J. JOHNSON, ARANCHA PEÑIL CELIS, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, JASON P. FOLSTER

21/06/2022

Characterization of the DNA binding domain of StbA, a key protein of a new type of DNA segregation system

Artículo de Revista

Journal of Molecular Biology, 2022, 434(19), 167752

Autoría: VALENTIN QUEBRE, IRENE DEL CAMPO GUTIÉRREZ, ANA CUEVAS VENERO, PATRICIA SIGUIER, JÉRÔME RECH, PHAN THAI NGUYENLE, BAO TON-HOANG, FRANÇOIS CORNET, JEAN-YVES BOUET, GABRIEL MONCALIAN MONTES, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, CATHERINE GUYNET

2022

Synechococcus elongatus PCC 7942 as a platform for bioproduction of omega-3 fatty acids

Artículo de Revista

Life 2022, 12(6), 810

Autoría: MARIA DEL CARMEN SANTOS MERINO, RAQUEL GUTIÉRREZ LANZA, JUAN NOGALES, JOSÉ LUIS GARCÍA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

29/05/2022

Genome sequences of 18 Salmonella enterica serotype hadar strains collected from patients in the United States

Artículo de Revista

Microbiology Resource Announcements, 2022, 11(10), e0052222

Autoría: HATTIE E WEBB, JUSTIN Y KIM, KAITLIN A TAGG, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, ARANCHA PEÑIL CELIS, BETH TOLAR, ZACHARY ELLISON, COLIN SCHWENSOHN, JOSHUA BRANDENBURG, MEGIN NICHOLS, JASON P FOLSTER

2022

Structural basis of direct and inverted DNA sequence repeat recognition by helix-turn-helix transcription factors

Artículo de Revista

Nucleic Acids Research, 2022, 50(20), 11938-11947

Autoría: RAUL FERNANDEZ LOPEZ, RAUL RUIZ GONZALEZ, IRENE DEL CAMPO GUTIÉRREZ, LORENA GONZALEZ MONTES, ROELAND BOER, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, GABRIEL MONCALIAN MONTES

2022

Targeted bacterial conjugation mediated by synthetic cell-to-cell adhesions

Artículo de Revista

Nucleic Acids Research, 2022, 50(22), 12938-12950

Autoría: MARTA ROBLEDO GARRIDO, BEATRIZ ÁLVAREZ, SHEILA GONZÁLEZ GUTIÉRREZ, DAVID RUANO-GALLEGO, LUIS ÁNGEL FERNÁNDEZ, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

2022

PLASmid TAXonomic PCR (PlasTax-PCR), a multiplex relaxase MOB typing to assort plasmids into taxonomic units

Capítulo de libro

PCR primer design

Autoría: RAQUEL CUARTAS, TERESA M. COQUE, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA

2022

COPLA, a taxonomic classifier of plasmids

Artículo de Revista

BMC Bioinformatics, 2021, 22(1), 390

Autoría: SANTIAGO REDONDO SALVO, ROGER BARTOMEUS PEÑALVER, LUIS ANTONIO VIELVA MARTINEZ, KAITLIN A. TAGG, HATTIE E. WEBB, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

31/07/2021

Conjugation inhibitors effectively prevent plasmid transmission in natural environments

Artículo de Revista

MBio, 2021, 12(4), e0127721

Autoría: CAROLINA PALENCIA GANDARA, MARIA GETINO REDONDO, GABRIEL MOYANO, SANTIAGO REDONDO SALVO, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, BRUNO GONZÁLEZ-ZORN, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

2021

Genomic insights into drug resistance and virulence platforms, CRISPR-Cas systems and phylogeny of commensal E. Coli from wildlife

Artículo de Revista

Microorganisms, 2021, 9(5), 999

Autoría: CARLA ANDREA ALONSO, MARÍA DE TORO, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, CARMEN TORRES

2021

Population genomics and antimicrobial resistance dynamics of Escherichia coli in wastewater and river environments

Artículo de Revista

Communications Biology, 2021, 4(1), 457

Autoría: JOSE F. DELGADO-BLAS, CRISTINA M. OVEJERO, SOPHIA DAVID, NATALIA MONTERO, WILLIAM CALERO-CACERES, MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, MAITE MUNIESA, DAVID M. AANENSEN, BRUNO GONZALEZ-ZORN

2021

Propionate fermentative genes of the gut microbiome decrease in inflammatory bowel disease

Artículo de Revista

J Clin Med . 2021 May 18;10(10):2176

Autoría: JUAN MANUEL MEDINA, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, JAVIER CRESPO GARCIA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

2021

La fidelidad en la transducción de la señal limita la capacidad informativa de los sistemas bacterianos de un componente

Comunicación a Congreso

SEM@foro 2021 Dic, nº72, p.43

Autoría: MIGUEL BAEZ MARTIN, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, RAUL FERNANDEZ LOPEZ

2021

Sistemas de Secreción Tipo VI como armas móviles

Comunicación a Congreso

SEM@foro 2021 Dic, nº72, p.46

Autoría: MARIA DEL MAR QUIÑONERO CORONEL, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA

2021

Integrated strategy for the separation of endotoxins from biofluids. LPS capture on newly synthesized protein

Artículo de Revista

Separation and Purification Technology, 2021, 255, 117689

Autoría: ARANTZA BASAURI PENAGOS, MARCOS FALLANZA TORICES, LAURA GINER ROBLES, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, GABRIEL MONCALIAN MONTES, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, INMACULADA ORTIZ URIBE

15/01/2021

A role for gut microbiome fermentative pathways in fatty liver disease progression

Artículo de Revista

Journal of Clinical Medicine, 2020, 9(5), 1369

Autoría: PAULA URUZUBIETA, JUAN M MEDINA, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, JAVIER CRESPO, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

2020

Biochemical interactions between LPS and LPS-binding molecules

Artículo de Revista

Critical Reviews in Biotechnology, 2020, 40 (3), 292-305

Autoría: ARANTZA BASAURI PENAGOS, CRISTINA GONZALEZ FERNANDEZ, MARCOS FALLANZA TORICES, EUGENIO BRINGAS ELIZALDE, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, LAURA GINER ROBLES, GABRIEL MONCALIAN MONTES, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, INMACULADA ORTIZ URIBE

2020

Pathways for horizontal gene transfer in bacteria revealed by a global map of their plasmids

Artículo de Revista

Nature Communications, 2020, 11(1), 3602

Autoría: SANTIAGO REDONDO SALVO, RAUL FERNANDEZ LOPEZ, RAUL RUIZ GONZALEZ, LUIS ANTONIO VIELVA MARTINEZ, MARIA DE TORO HERNANDO, EDUARDO P. C. ROCHA, MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA

17/07/2020

ArdC, a ssDNA-binding protein with a metalloprotease domain, overpasses the recipient hsdRMS restriction system broadening conjugation host range

Artículo de Revista

PLoS Genetics, 2020, 16(4), e1008750

Autoría: LORENA GONZALEZ MONTES, IRENE DEL CAMPO GUTIÉRREZ, MARIA PILAR GARCILLAN BARCIA, FERNANDO DE LA CRUZ CALAHORRA, GABRIEL MONCALIAN MONTES

01/04/2020

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Isolation and phenotypic and genomic characterization of Tetragenococcus spp. from two Spanish traditional blue-veined cheeses made of raw milk

Evolution of plasmid mobility: origin and fate of conjugative and nonconjugative plasmids

Five complete Salmonella enterica serotype reading genomes recovered from patients in the United States

Characterization of the DNA binding domain of StbA, a key protein of a new type of DNA segregation system

Synechococcus elongatus PCC 7942 as a platform for bioproduction of omega-3 fatty acids

Genome sequences of 18 Salmonella enterica serotype hadar strains collected from patients in the United States

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Targeted bacterial conjugation mediated by synthetic cell-to-cell adhesions

PLASmid TAXonomic PCR (PlasTax-PCR), a multiplex relaxase MOB typing to assort plasmids into taxonomic units

COPLA, a taxonomic classifier of plasmids

Conjugation inhibitors effectively prevent plasmid transmission in natural environments

Genomic insights into drug resistance and virulence platforms, CRISPR-Cas systems and phylogeny of commensal E. Coli from wildlife

Population genomics and antimicrobial resistance dynamics of Escherichia coli in wastewater and river environments

Propionate fermentative genes of the gut microbiome decrease in inflammatory bowel disease

La fidelidad en la transducción de la señal limita la capacidad informativa de los sistemas bacterianos de un componente

Sistemas de Secreción Tipo VI como armas móviles

Integrated strategy for the separation of endotoxins from biofluids. LPS capture on newly synthesized protein

A role for gut microbiome fermentative pathways in fatty liver disease progression

Biochemical interactions between LPS and LPS-binding molecules

Pathways for horizontal gene transfer in bacteria revealed by a global map of their plasmids

ArdC, a ssDNA-binding protein with a metalloprotease domain, overpasses the recipient hsdRMS restriction system broadening conjugation host range