El Comité Científico Externo es nombrado por la Comisión Rectora, oída la Junta, y está constituido por científicos de alto prestigio internacional, expertos en las líneas de investigación del Instituto. Entre las funciones del Comité, destacan:
- Asesorar, a solicitud de la Dirección, previo conocimiento de la Comisión Rectora, sobre el desarrollo de las líneas y proyectos de investigación.
- Asesorar a la Comisión Rectora, a solicitud de la misma, en cualquier aspecto del trabajo de investigación del Instituto.
- Asesorar a la Junta previo conocimiento de la Comisión Rectora en la elaboración del Plan Estratégico, así como proceder a su informe, en su caso, previamente a la aprobación por este Órgano.
- Informar a petición de la Comisión Rectora sobre las solicitudes de los investigadores que aspiren a incorporarse al IBBTEC.
- Valorar, en su caso, las candidaturas propuestas en el proceso de elección de la Dirección.
- Cuantas otras funciones puedan serle encomendadas.
Actualmente, son ocho los miembros del Comité Científico Externo:
Cecília Arraiano (ITQB Nova, Portugal) | Mariano Barbacid (CNIO) | Eric Cascales (LISM - CNRS, Francia) |  Denis Duboule (EPFL, Suiza) |
Aitziber López Cortajarena (CIC biomaGUNE) | Suzana P. Salcedo (UW-M, EE.UU.) | Olga Valverde Granados (UPF) | Ana Zubiaga Elordieta (UPV) |
