Ha colaborado en la creación y puesta en funcionamiento de la "Biblioteca Electrónica Emilio Botín", tanto en los apectos de infraestructura y equipo como en la dotación de contenidos electrónicos documentales. A partir de 2014, financia con una cantidad importante los proyectos Biblioteca Digital y Biblioteca Electrónica Emilio Botín en virtud de un convenio de colaboración entre la UC y el Banco.
Entre los años 1999 y 2013, la Fundación ha colaborado regularmente con la BUC: en la creación y puesta en funcionamiento de la "Biblioteca Electrónica Emilio Botín" dentro del proyecto Hacia la Biblioteca Electrónica y, dentro del mismo proyecto, en la adquisición y actualización de bases de datos y fuentes electrónicas relevantes para la comunidad universitaria.